预防肠道菌群失调的发生，应从机体内外两个方面加强管理。患有慢性消耗性疾病又确有感染的患者(如信中提到的蔡先生)在使用抗生素时，应严格掌握适应症，作药物敏感试验，有针对性地选择最敏感的窄谱抗生素治疗，并尽量肠道外给药，而且用量不宜过大，疗程不宜过长，应杜绝无理由地长期大量使用广谱抗生素。老人、婴幼儿及病后体弱者在使用抗生素或者激素的同时，可以配合使用微生态调节剂和适量补充维生素。