近年来, 随着对肠道菌群调控作用研究的不断深入，发现肠道菌群不仅调控肠道活动，还影响宿主的脑功能和行为。

肠道菌群通过肠-脑轴调控宿主行为，而肠-脑轴是由免疫、神经内分泌和迷走神经途径构成的肠道和脑之间的交流系统。 动物研究和临床观测结果表明，肠道菌群通过肠-脑轴对宿主的应激反应、 焦虑、 抑郁和认知功能产生重要影响。

平衡的肠道菌群可以促进宿主的身心健康，而肠道菌群失调则可能引发肠-脑疾病(如肠易激综合征、炎性肠道疾病和肝性脑病)和中枢神经系统疾病(如多发性硬化症、阿尔兹海默症和自闭症等)。

深入了解肠道菌群对宿主行为的影响，有助于更好地理解肠易激综合征和多发性硬化症等的发病机理，并认识到调节和恢复正常肠道菌群的安全有效措施(补充益生菌)是治疗精神心理疾病的重要组成部分。